Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms