Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms