Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms