Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms