Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms