Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms