Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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