Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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