Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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