Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms