Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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