Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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