Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms