Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprsB0V2N1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms