Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr16A3KMN5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms