Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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