Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GabreA2AMW3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GabreA2AMW3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms