Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SetxA2AKX3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms