Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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