Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms