Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd2V9GX34 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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