Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Top3bQ9Z321 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Top3bQ9Z321 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.2 ms