Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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