Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubl3Q9Z2M6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms