Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms