Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp11cQ9QZW0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms