Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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