Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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