Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms