Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms