Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Nr2e3Q9QXZ7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nr2e3Q9QXZ7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nr2e3Q9QXZ7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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