Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tnfrsf19Q9JLL3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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