Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FancaQ9JL70 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FancaQ9JL70 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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FancaQ9JL70 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FancaQ9JL70 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FancaQ9JL70 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms