Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gde1Q9JL56 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gde1Q9JL56 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gde1Q9JL56 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gde1Q9JL56 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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