Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hmgn5Q9JL35 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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