Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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