Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms