Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms