Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pgpep1Q9ESW8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms