Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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