Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms