Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms