Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms