Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med29Q9DB91 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med29Q9DB91 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms