Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Asf1bQ9DAP7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms