Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9R0

Rnf125, E3 ubiquitin-protein ligase RNF125, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf125Q9D9R0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf125Q9D9R0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms