Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms