Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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