Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms