Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn22Q9D7U6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms